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pET-28a质粒图谱怎么看?

 每个实验室都有各种各样的载体,每个实验阶段也在使用不同的载体。


那么,你对你使用的载体了解多少呢?


我随机采访了几个生物专业的硕士同学:


同学A(做大肠表达): GEX-4T-2载体,大肠表达载体,大小约为5 kb,抗性为Amp,带有GST标签,有BamHI以及EcoRI酶切位点.....

 

:那...有看过图谱吗?


同学A:木有  (キ`゚Д゚´)!!


同学B(做酵母表达): pPICZα/A载体,毕赤酵母表达载体,大小约为3.5kb,抗性为Zeocin


同学C(做大肠表达)pET-28a(+),载体,大肠表达载体,大小约为5.4kb,抗性为Kana,6xHis标签


...然而,他们
都没有看过载体图谱!


那么,我们今天就来讲讲载体图谱!


其实,在美露的眼里,载体是这样的:

比如,pET-28a(+)

首先它是大肠表达载体,大小为5369 bp,胞内表达目的基因

然后,我们对其元件进行一个个的分析:


  1. 复制子:ColE1/pMB1/pBR322/pUC ori——起始载体的复制;f1 ori——f1噬菌体复制子,显示正义链合成方向

  2. KanR:编码氨基糖苷磷酸转移酶,在原核细胞中产生卡那霉素抗性,在真核细胞中产生遗传霉素筛选标记

  3. Rop:编码ROP蛋白 ,使得质粒维持低拷贝水平

  4. 乳糖操纵子元件——lacI promoter+ lacI (启动阻遏蛋白的表达,是lac operator的抑制因子),lac operator(lac操纵基因,阻遏蛋白与之结合后抑制其后基因的表达,乳糖类似物IPTG可与阻遏蛋白结合从而失去对lac operator的控制,进而使得其后基因正常表达)

  5. T7 promoter:受控于T7 RNA聚合酶的启动子,是当今大肠杆菌表达系统的主流。 强大的T7启动子完全专一受控于T7 RNA聚合酶,而高活性的T7 RNA聚合酶合成mRNA的速度比大肠杆菌RNA聚合酶快5倍,当二者同时存在时,宿主本身基因的转录竞争不过T7表达系统,几乎所有的细胞资源都用于表达目的蛋白。

  6. 6xHis(6xHis亲和标签):MCS区C端和 N端各有一个,编码6个连续的His,用来作为纯化目标蛋白的标签

  7. throbin site:Thrombin蛋白酶切位点

  8. T7 tag:提升翻译效率

  9. MCS:多克隆位点区域

  10. T7 terminator:受控于T7 RNA聚合酶的终止子


接下来是第二个载体

pPICZα/A

它是毕赤酵母表达载体,大小为3593 bp

整合型载体(将DNA整合到毕赤酵母基因组上以实现表达)

可将目的蛋白分泌到胞外

然后,它的元件:

  1. ori:ColE1/pMB1/pBR322/pUC 复制子:起始载体的复制

  2. AOX1 promoter:甲醇诱导型启动子,表明载体需要甲醇诱导才可表达

  3. α-factor secretion signal:分泌信号肽,使得目的基因表达的蛋白分泌到胞外

  4. MCS:多克隆位点

  5. Myc:载体标签,有对应抗体,可用于做 western-blot杂交应用中。

  6. 6xHis:(6xHis亲和标签):MCS区C端和 N端各有一个,编码6个连续的His,用来作为纯化目标蛋白的标签

  7. AOX1 terminator:转录终止子

  8. TEF1 promoter:EF-1α启动子-在真核细胞中启动抗性结合蛋白的表达

  9. EM7 promoter:细菌启动子-在原核细胞中启动抗性结合蛋白的表达

  10. BleoR:Zeocin抗性基因

  11. CYC1 terminator:转录终止子

 

当然,有时候并不需要你这么仔细的去分析载体


但是对于载体的基本元件还是要知悉的,比如载体启动子,抗性元件,多克隆位点,载体标签


当你看懂了这些元件后,你就会懂得:为什么这个载体是诱导型载体?为什么这个载体可以用XX标签纯化?等等


但是有很多小伙伴表示不会看载体图谱

那么美露就来分享一下多年以来的经验

 

1.准备工作:

确定了载体之后(点击图片放大就能看清楚啦)

好啦,今天关于载体的内容就到这里啦~


我是丰晖生物

分子技术支持——贾美露

这是我的第一篇文章,希望大家多多支持

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